一队bioinformaticians席勒大学在耶拿,德国,由塞巴斯蒂安教授领导离任,连同他们的合作者在芬兰阿尔托大学,芬兰,开发出了一种搜索引擎,大大简化了代谢产物的分子结构鉴定。他们描述他们的搜索引擎“CSI: FingerID”在一篇论文美国国家科学院院刊》上的美利坚合众国(PNAS)。
在这种情况下CSI代表化合物结构鉴定和基于各种方法相结合。首先,代谢物待分析样品进行串联质谱分析。“在这一步中,分子拆除成更小的碎片和它们的分子量确定”,薄满乐解释道。由此产生的光谱给代谢物的化学成分的信息,但是这些信息还没有足够的有关分子结构得出结论。这是新开发的搜索引擎。它的工作原理类似于一个互联网搜索引擎,搜索关键词,而是工具寻找分子信息,将给定的质谱转换为结构的公式。质谱后提交给搜索引擎,“CSI: FingerID拖网在线分子结构数据库,在世界各地的科学家发布信息和结构公式新发现和知道代谢物。单个“CSI: FingerID”搜索结果列表中可能的候选结构的对应的光谱。
“获得可能的候选人名单后,我们仍然不知道绝对确定性的代谢物我们正在处理。但当我们可以减少可能的化合物也许从几千到十,这是巨大的进步”,薄满乐说。“因为精确的实验室测试来确定化合物可以是昂贵和耗时,因此成千上万的可能性之间的区别通常是不可能,但测试10个化合物通常是可行的。”,相关的数据库也增长总是与平均每分钟十个条目被添加在全球基础搜索结果变得更精确。
bioinformaticians显示在这个新的研究中,他们和他们的方法获得更高的命中率比任何其他方法,到目前为止已经使用。为此,他们验证搜索引擎有超过6000个测试物质。以及使用“CSI: FingerID”本身来分析天然代谢物,薄满乐教授和他的团队取得了国际科学界的搜索引擎免费:http://www.csi-fingerid.org。
