一个星期一个博士生的生活

凯蒂灰烬

爱丁堡大学和斯特拉斯克莱德大学。电子邮件:(电子邮件保护)

周一

走到干草市场站,我避免好奇的盯着乘客。我试着不去嫉妒小手提包或公文包紧凑。我试图保持一个稳定的课程和一个冷淡的看。因为在早上8点钟,很难保持不显眼的同时推着一个大黄色鹈鹕在爱丁堡的大街上。

鹈鹕病例最初设计用于军事和执法。他们是耐用,防水,通常用于运输敏感设备,如摄像头或枪支,但我的货物明显书呆子气:785海里便携式拉曼光谱仪。爱丁堡大学的一些试验后,我现在返回设备国内大学的斯特拉思克莱德在格拉斯哥。

我拖的情况下通过障碍,举起它从一个平台到另一个火车和花剩下的旅程阅读论文的同时保持敏锐地意识到房间多少光谱仪在行李架。

我中途我博士学位的最后一年光学医学成像,和大学之间的合作和部门的很大一部分我的项目。我的研究的目的是开发一种检测肝损伤使用光谱和它是跨学科的。半岛综合体育官方APP下载德甲为了达到这个目标,我一直与物理学家、化学家、生物学家和移植外科医生在城市爱丁堡和格拉斯哥。它涉及大量的旅行,但这是一个伟大的方式来学习一大堆不同的主题和很少有无聊的一天。

58分钟后火车拉干草市场,我来到斯特拉思克莱德的技术和创新centre-affectionately称为抽搐。对于这样一个不愉快的缩写,它是一个华丽的建筑。从鸟瞰三角,及其七个故事拥有最先进的实验室开展一些苏格兰最创新的研究,从可再生能源到光子。

我的上司这是凯伦Faulds,纯粹与应用化学教授纳米技术中心。Professsor Faulds的工作着重于生物应用拉曼光谱技术,使用激光产生的非弹性散射分子样品的信息。半岛综合体育官方APP下载德甲

有很多变化的主题拉曼光谱和Faulds教授的小组利用他们。半岛综合体育官方APP下载德甲例如,表面增强拉曼光谱(ser)采用金属纳米粒子(或其他金属表面)提高否半岛综合体育官方APP下载德甲则弱拉曼信号。

这些粒子和表面可以用分子functionalised绑定到特定的细胞或对特定的环境条件,告诉我们关于器官的健康。它不是一个技术我已经使用,但Faulds组用ser检测多种类型的致病菌。^1、2

迎头赶上后短暂的一些其他学生在抽搐,我小心翼翼地把光谱仪实验室的长凳上,打开徕卡多光子显微镜。科学家可能不应该最喜欢的乐器,因为他们都有各自的优点和局限性,但是很难不去爱的多光子。

徕卡多光子显微镜的斯特拉思克莱德大学的。

如果有人说:“想象一下,一个奇特的显微镜设计的蝙蝠侠”,这就是徕卡看起来像一个巨大的,闪闪发光的,墨黑的外部住房一个闪烁的各式各样的过滤器,反射镜和透镜。软件,然而,似乎是由世界上最大的风扇的彩虹,老实说,这是一个受欢迎的除了黑暗显微镜的房间。

徕卡的一个主要优点是它具有多个激励源,汽车贷款,SRS和荧光成像功能。受激拉曼光谱(SRS)和相干ant半岛综合体育官方APP下载德甲i-Stokes拉曼光谱(汽车)利用两个激光器:泵浦光和斯托克斯光束。通过调优这些激光特定频率,可以增强拉曼信号的转变。虽然这限制了光谱信息,可以获得高质量、高分辨率图像的目标在极短的时间内达到顶峰。

例如,您可以标签与炔感兴趣的分子标记。由于炔烃拉曼信号中间的“细胞沉默”区域,标记分子的分布可以快速成像。

在显微镜下,一天后我坐火车回到赫马基特携带我的小背包和一个USB的图像。

周二

论文写作的一天。我早上六点半闹钟响:早上我更有效率。除此之外,是考试的季节,图书馆就挤满了本科生的天如此包装有时唯一可用的办公桌空间是在楼下的咖啡馆。我的小紫笔记本奄奄一息,爱丁堡大学图书馆有成百上千的台式电脑,配有软件必要参考,创建图表和统计分析。这并不奇怪,它是如此受欢迎。

我一直在写我的结果成纸和处理数据,我走到哪里,这非常有用。论文写作也保证我一直使用多个方法来证实我发现在我的博士学位。虽然拉曼光谱信息,没有单一的实验技术能充分明确证明的东西,特别是在生物科学领域。出于这个原因,我一直在使用特征明显技术,如核磁共振和拉曼光谱和并行组织学染色来支持我的发现。半岛综合体育官方APP下载德甲

核磁共振半岛综合体育官方APP下载德甲光谱使用磁场和射频电磁辐射诱导能量转换示例。获得的峰值是明显比拉曼和红外光谱,所以你可以解决单个分子更容易。半岛综合体育官方APP下载德甲然而,核磁共振需要样品的形式biofluids或活检,限制了其应用的诊所。然而,我使用核磁共振测量受损肝脏的代谢状况的变化与控制肝脏和这些光谱今天我一直关注。

11:15,我的眼睛不能采取任何更多的核磁共振光谱和我渴望咖啡因,所以我离开了我的桌子,走到一个小咖啡盒在乔治广场。它看起来有点像TARDIS(它实际上是一个老警察框),他们成为优秀的美式咖啡。

那么这种大厅日落时乔治广场附近。

回到图书馆,电子邮件说实验室会议仍在继续。实验室会议。酷。我绝对不会忘记。我的化学主管,科林·坎贝尔博士目前正在休假在科罗拉多州,他正在开发的方式培养和3 d成像细胞,通过Skype和我们实验室会议。

团队的其他成员在232房间在化学学院,这是一个很好的机会赶上其他组的成员。我们中的许多人在不同的部门工作,所以很容易忘记,还有那些面临类似的问题在另一个点在他们的博士学位。我们都受益后,建议在这些会议上展示我们的工作。

其他学生在坎贝尔博士的小组已经以类似的方式使用ser研究员斯特拉思克莱德,但功能纳米粒子与redox-sensitive分子。随着环境的氧化还原状态的变化,所以做分子的拉曼光谱与金属纳米粒子。因此,拉曼光谱可以作为读出3 d细胞内氧化还原状态的文化甚至肿瘤模型。³

会议结束后,我直接去健身房。大学建筑只有几年的历史,配备了有氧运动室,自由重量器械,固定权重,篮球和壁球场,以及一个攀岩墙。我的目标是锻炼每周至少五次;是否在健身房,或运行在草地踢足球。它让我从博士生活完全关掉;我热爱科学,把工作和家庭分开。

春天的草地乔治广场附近的图书馆。

周三

24路车蜿蜒穿越什么感觉整个爱丁堡,但最终我们来到了皇家医院。今天早上,我有一个会议与加布里埃尔Oniscu先生,移植外科医生我与皇家合作。的原因之一,我们正在开发一种使用光谱检测肝损伤是看看我们是否可以评估捐赠肝脏的健康。半岛综合体育官方APP下载德甲

肝移植是六到八小时,他们非凡的观察。整个团队的护士、医生和anaesthetists-remain警报和集中在整个过程中,每个执行自己的保健至关重要的作用。然而,移植的一个团队使用主观评估期间捐献肝脏。操作外科医生主要实现通过视觉检查肝脏和检查它不是脂肪或明显受伤。能够在分子水平上检测损伤实时将是无价的。

不幸的是,激光设备引入的移植过程远非简单。Oniscu先生和移植剧院妹妹菲奥娜亨特女士已经实际的重要来源,临床相关信息。任何光谱解决方案必须能够考虑手术灯、运动和生物化学在患者身上的变化。设备需要提供分子的信息而不需要外科医生分析原始光谱数据。它能够做的如此之快。

Oniscu先生和我交谈后通过我的最近结果,我和另一位博士生有肝脏样品分级的病理学家,并邀请我。评估样本,病理学家与多个目镜使用显微镜,所以我和其他学生可以清楚地看到他在说什么。我们学到了很多。

“这些白色斑点是液泡,可逆细胞损伤的标志…在这里,你有坏死,它只是在一个小区域。“坏死是细胞死亡的一种移植外科医生想要避免的。肝脏再生的非凡能力,但严重程度的坏死可能导致疤痕,损失函数和癌症。

我们的迷你病理学教程后,之前我们从医院的咖啡厅喝一杯咖啡,回到办公室来有意义的新结果。

周四

“让我们试着降低收购时间,更高的激光功率;只是想看看会发生什么。”

今天早上,我正在教一个新博士生如何使用英国InVia拉曼光谱仪。这是比我们预期的更费时,尤其是她的样品瀑样(微小的球体的细胞)和我们不确定哪些数据。英国,有很多参数你可以改变:激光功率、采集时间、简化或收购,镜头,地图大小……有两个激光- 532 nm和785 nm激发。

英国爱丁堡Bioquarter InVia。

此外,还有独特的挑战要面对当使用生物样本。有时你将使用冰冻切片,其他时间在单层细胞生长,有时biofluids如血清。每个样本有不同的光学特性,因此必须调整相应的试验装置。同样重要的是确保周围的介质不给一个强大的拉曼信号,将淹没的信号分子尝试检测。

然后是激光强度的问题。当我第一次开始使用肝组织,我运行一个映射的光谱仪实验8小时。当时的想法是把成千上万的光谱从一个小矩形内的组织。我回来第二天早上发现一个完美的500到700年µmµm长方形的汽化从我的样本。

后我们确定最优参数的实验中,我坐公共汽车到商学院乔治广场。我知道你的想法,学习商业适合检测肝损伤吗?这是一个很好的问题:我是一个成员的最适条件,博士训练中心光学医学成像。许多科学家缺乏技能,把他们的想法从板凳上业务,所以这四年计划已专门设计用于帮助博士生获得创业培训以及跨学科的科学。

在这个模块中,我们的团队一直在学习第一阶段试验的步骤需要进行植入正确的市场。我们已经学过的知识产权,伦理和融资是一个有趣的课程,我希望所有生物医学科学家能够看透这些过程。

星期五

周五上午是福布斯集团实验室会议,基于再生医学中心的(CRM)。斯图亚特·福布斯教授是我的临床导师和顾问在皇家医院肝脏病学家。他的实验室在CRM专门从事肝脏regeneration-a复杂和迷人的过程。给定的时间,人类肝脏能够恢复即使大部分结构和功能受损或删除;和福布斯集团旨在发现这背后的细胞机制的过程。⁴

其他实验室成员大多使用光学显微镜、生物化学和蛋白质组学技术,但他们一直在默默奉献的教我如何处理组织样本和解释数据的肝脏的生理状态。在实验室的多样性的知识和技能是惊人的,他们给我访问细胞系,小鼠模型,大鼠模型,病人肝脏活检和抛弃。细胞系更容易获得比整个器官和生物复杂。然而,他们不是真实反映国家在生物这是有用的能够对组织样本进行实验。

会议结束后,我下午工作会议上表示坎贝尔办公室在学校的化学。每隔几个月,我要出席一个会议或者做某种形式的公众参与:研究的影响是有限的,如果你不交流更广泛的受众。幸运的是,我的上司都非常令人鼓舞的科学传播,我有机会在伦敦、巴塞罗那和加拿大观众从学生到医生。

IRDG圣诞会上演讲,2018年12月。

一旦PowerPoint情况良好,是时候去南部——酒吧时常光顾,博士和博士后。今天是周末,我们的谈话即将到来的假期,运动和对明年的计划我们的生活。失败的实验和博士被遗忘的问题。

最后的想法

博士并不适合所有人,在开始之前,值得研究的项目,实验室文化和城市你要打电话回家。研究生学位可以心理和情感过山车:我时刻NMR管破碎,在实验上运行17小时,我的整个第一年的工作已经提出“优化”。但是,这些都是微不足道的挫折在不可思议的三年。

我已经免费学习无数新的研究技术,开发的语言交流技能和探索科学的多个领域。所有事情考虑;我不会改变过去几年。

引用

1. k .格雷西d·林赛·格雷厄姆和k . Faulds“细菌性脑膜炎病原体识别在临床使用ser DNA样本检测试验”,肛交。方法7,1269 - 1272 (2015)。https://doi.org/10.1039/C5AY00063G
2. h·卡恩斯r . Goodacre l .杰米逊·d·格雷厄姆和k . Faulds”ser多个antimicrobial-resistant病原体的检测用纳米传感器”,肛交。化学。89年,12666 - 12673 (2017)。https://doi.org/10.1021/acs.analchem.7b02653
3. L.E.吞云吐雾,a . Jaworska j .江m . Baranska D.J.哈里森和C.J.坎贝尔,“同时细胞内氧化还原电位和pH值测量在活细胞中使用ser纳米传感器”,分析师140年,2330 - 2335 (2015)。https://doi.org/10.1039/C4AN02365J
4. 中华民国福布斯和期票Newsome”,肝再生机制和模型临床应用”,Nat,启杂志。乙醇。13 (8),473 - 485 (2016)。https://doi.org/10.1038/nrgastro.2016.97