o·大卫·斯帕克曼
化学兼职教授和主任太平洋质谱设备,化学系,斯托克顿、钙、美国太平洋大学。(电子邮件保护)
2020年4月27日
一组已知化合物的质谱和程序用于搜索不明化合物的光谱是两个不同的实体。获得的结果取决于两种。可以找到两个不同的化合物作为第一个击中时执行搜索相同的频谱利用NIST质谱(MS)搜索项目(国家标准与技术研究院,马里兰州,美国)搜索NIST / EPA / NIH EI质谱库(NIST 20)或威利注册中心的大规模光谱数据,12th版(美国新泽西州霍博肯约翰·威利& Sons)。可以找到两个不同的化合物作为第一个打击时,NIST / EPA / NIH EI质谱库(NIST 20)搜索使用NIST女士搜索程序v.2.4或基于概率匹配(PBM)搜索程序,这是一个部分的安捷伦科技(美国圣克拉拉,CA) ChemStation数据分析程序。即使相同的质谱搜索对两个不同版本的NIST / EPA / NIH EI质谱库(NIST 14和NIST 20)使用相同的搜索程序(NIST 20 MS的搜索v.2.4)两种不同的化合物可以作为第一个打击。
没有这些差异的根源。在NIST的搜索的例子区别14和NIST 20 EI库使用相同的搜索程序,它可以简单的身份不明的化合物的光谱之间的库版本。光谱大约60 K ~这两个版本之间加入了新的化合物。最先,或者不同的差异可能是由于复杂的搜索算法的NIST女士vs ChemStation PBM搜索的搜索程序。
关键是,不仅需要特定的出版商库还版的质量谱库以及使用搜索程序。NIST因为我的参与,我订阅了两个搜索字符串在谷歌2014年10月5日以来学者警告([NIST质谱数据库]和[NIST“大规模光谱| |光谱谱”))。在此期间,我收到了这两个字符串的引用列表每两到五天。每个列表包含5 - 20引用文章提到的两个NIST质谱库(NIST / EPA / NIH的EI谱库或NIST串联图书馆产品-离子质谱)。许多这样的引用也引用威利注册表有时其他小库的风味和香味EI图书馆罗伯特·p·亚当斯(暗黑破坏神分析、安提阿、钙、美国),毛雷尔/ Pfleger /韦伯质谱库的药物/毒药/农药/污染物及其代谢产物2011版(约翰·威利& Sons),设计师药物2020年彼得Rosner EI质谱库(约翰·威利& Sons), SWGDRUG质谱库等等,更不用说一些许多小的质量谱库。
经常引用的搜索质量光谱库仅仅是。“未知的身份被确认使用NIST库。“不幸的是,不超过20%的文章引用的版本(版本)质谱库,和几乎每一个缺失条提到的程序用于搜索库。当有人购买乐器,他们将购买质量光谱库。今天,这是真实的气相色谱/质谱(GC / MS)比串联质谱仪用于液相色谱仪器,但在NIST的引入串联ThermoFisher图书馆和事实是每个串联为一份图书馆提供仪器销售,这将会改变。
也不幸的人在2020年发表的一篇文章中,NIST EI图书馆于1998年发布。
随着这些乐器的年龄,研究人员使用,特别是那些不是质量spectrometrists,没有意识到很容易和便宜的升级工具,像质谱库,搜索程序可以大大扩大现有仪器的实用性,是可用的。
期刊文章作者的主要原因不仅需要包含的名称和版本质量光谱库用来证实或程序识别未知的化合物也被用来搜索这些库,所以他们的读者可以评估结果的有效性。
它是不够的,”组件的身份被确认通过搜索他们的质谱,另外,针对NIST和威利库”。这句话应该读,”组件的身份被确认通过搜索他们的质谱,分别与NIST 17和威利8库使用内部库搜索算法为日本岛津公司GC / MS解决方案V.4.5软件”。(日本岛津公司GC / MS解决方案软件,像大多数其他GC / MS数据系统,只允许一个质谱库搜索。)PerkinElmer,水域,安捷伦的ChemStation (GC / MS和LC / MS)和安捷伦的MassHunter(质量和全),Sciex,力量和其他人都有他们的完全独立的私有库搜索程序甚至通过许多提供NIST女士女士搜索程序和库搜索格式以及他们专有的格式。这些专有的程序和格式可以改变改变版本的工具软件,他们陪;这就是为什么数据分析软件的版本号应该是一个引用的一部分。女士与NIST的可用性搜索和其他第三方搜索程序以及软件的优先搜索,它绝对是强制性的,搜索软件被指定。
应该记住,NIST的女士搜索程序既有身份搜索(使用时怀疑不明化合物的光谱库中搜索)和相似性搜索(使用时怀疑没有不明化合物的光谱搜索库)。在NIST女士搜索程序(v.2.4),伴随NIST 20,有四个不同的身份搜索(EI正常,快,MS / MS和将员工)和五个不同类型的相似性搜索(EI混合动力车,简单,EI中性丢失,女士在EI / MS和MS / MS混合,用于生产从大气压电离质谱产生precursor-ions)。因此,它是最好的,不仅所使用的版本是说,但同时,算法被用于报告的使用NIST女士搜索程序。NIST女士搜索的另一个独特的特性,与搜索例程提供大多数数据分析的软件例程,127可以搜索不同的库,同时进行。点击列出根据质量,而不是根据搜索顺序。
以下是适当的引用的例子使用在处理其中一个NIST质谱库和NIST女士搜索程序。
寻找一个电子电离作用光谱
识别身份不明的化合物的质谱是利用NIST质谱搜索程序的完成,v.2.4, EI NIST的正常身份搜索20 NIST / EPA / NIH EI质谱库(mainlib和/或replib)和(其他图书馆的名称(s) (ies)搜索]。如果使用任何搜索限制,这些也应该上市;特别是如果保留指数数据库使用。
寻找生产质谱
搜索的NIST 20串联图书馆(hr_msms_nist、lr_msms_nist apci_msms_nist或(biopep_msms_nist)和[名称(s)的任何其他生产质量光谱库(ies)搜索]是利用NIST搜索程序的女士(v.2.4) MS / MS混合相似性搜索。如果使用任何搜索限制,这些也应该列出。
再一次,它不能在强调图书馆的出版商,库版本和软件使用应该详细提到。
这封信给编辑被提交到多个期刊为了获得尽可能多的覆盖在这个话题。
