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的成本隐藏的细菌:挑战代表抽样和测量细菌负荷在一个工业屠宰场

亚伯Arkenbout

ToxicoWatch基金会,德克萨斯州的哈林根、荷兰

欧盟食品bdapp官方下载安卓版安全采取了一个集成的方法,称为“从农场到餐桌”,通过提供独立的科学对食品安全方面的支持和建议弯曲杆菌。鸡肉负责20 - 30 %肠胃炎的所有情况,而50 - 80的病例可以与鸡水库的细菌有关。存在一个过程卫生标准(PHC)的欧盟委员会规定的2017/1495 2017年8月23日,bdapp官方下载安卓版1修改监管(EC) 2073/2005号弯曲杆菌spp。过去的目的是控制污染的死鸡屠宰过程中通过监测和采取纠正措施时,违反规定目标。满意的监测结果(欧盟PHC标准:2020年1月1日)意味着,冷却后,不超过15的50采样尸体数量可能超过1000个集落形成单位每g。如果超过这一标准,改进必须使整个生产线,即采取适当的生物安全行动从农场到评审过程控制的屠宰场。

弯曲杆菌。信贷:Kateryna_Kon / stock.adobe.com

这一切始于代表性取样

如何抽样的基本知识,制定抽样(TOS)理论,介绍了微生物学领域的?测量是知道,这一切都始于代表性取样。在荷兰,170万只鸡屠宰和加工每一个一天。屠宰场容量的250000只鸡每天强制检查规则弯曲杆菌每周50种虫害的尸体样本对应一个样本的频率仅为0.004%。有这样一个抽样覆盖率极低主抽样必须完全可靠,所以TOS-compliant抽样过程是绝对必须的。当测试样品确实是完全代表,分析程序必须同样地;后者是“简单”来完成特别是抽样任务相比。

微生物范式转变

微生物分析是由在培养皿中培养微生物的黄金标准。这种由来已久的方法自1886年以来一直使用后出版的西奥多·Escherich (大肠杆菌细菌以他的名字命名)。这个出版后,连同著名微生物学家巴斯德和科赫的范式,只有病原菌培养和检查。

然而,一个戏剧性的转折点是在2005年,当Eckburg,基于16 s rRNA序列分析,发现了数以百计的完全未知的细菌种类在人类消化呼吸道,甚至超过了最常见的可耕种的物种的数量。从这一刻起,培养细菌培养皿被批评为“伟大的平皿计数异常”。这个标准实际上细菌检测方法检测只有1%的细菌。2

因此,“板总数(TPC)”不再对应在所有实际的微生物种群。3 - 5尽管如此严重的但书,培养皿培养方法仍然是食品工业用作务实的选择。

弯曲杆菌和VBNC

弯曲杆菌讲究的,它必须在非常特殊的条件下完成[micro-aerophilic capnophilic氛围(5%啊2,10%的公司2,85% N2)为41.5°C)在一个特定的板,抑制其它细菌的增长。重点是培养空肠弯曲杆菌,(c .空肠),弯曲杆菌杆菌(c .杆菌)。然而,这排除了其他弯曲杆菌菌株,如c . concisusc .胎儿肠胃炎,负责许多情况下的老人。

最重要的培养方法的异常问题忽略了viable-but-not-culturable(VBNC)细胞。这些细菌是引起暂时停止繁殖,虽然他们可能成为另一个致命的,更有利的环境。在实践中,这意味着鸡肉很可能测试为阴性弯曲杆菌在屠宰场的控制平台,而在零售层面检测呈阳性。这些新兴和仍然没有完全理解VBNC特征对人类健康构成严重威胁。

严重的微生物的影响

清洁的一个可能的缺点是一个激活的基因耐化学消毒剂,包括氯化产品。让事情更复杂,还发现了这些基因变化促进抵抗的广谱抗生素。这是新兴的,潜在的颠覆性,耐多药的问题弯曲杆菌

屠宰场提供了水库的各种各样的多个领域弯曲杆菌spp。弯曲杆菌展品伟大的遗传多样性,发现不同基因型在处理屠宰线。分析文化无关,如茎序列输入(MLST)和全基因组测序,发现生存的机制弯曲杆菌细菌。6这项研究的一个例子是遗传学的界限和定义不断进化的微生物之一的新时代。小说微生物基因组信息的数量每天产生如此巨大的多学科方法,结合生物信息学、统计学和数学方法需要有效地评估它。所有这些挑战需要具有高度针对性的代表性抽样方法与微生物密切合作分析。然而,今天,我们非常远离这一目标。

现代基因组学已经彻底改变了微生物学的方方面面。有迫切需要新的快速和可靠的微生物检测技术在生命科学和所有相关部门,特别是在食品行业。微生物学是极其复杂,但这一切都始于正确的采样。一个有用的起点就已经对食品和饲料中描述参考7中,特别注重考虑对水质分析。8需要创新的未来挑战和有理由保持谨慎的乐观态度,然而,有威胁迫在眉睫的地平线,尤其是耐多药(MDR)细菌快速繁殖。

经济影响

弯曲杆菌病是最常见的报道人畜共患病病(一种可由动物传播给人类)增加的趋势在欧盟。bdapp官方下载安卓版疾病在人们传统的影响量化非货币性而言,通常在形式的所谓的“残疾调整生命年(DALY)而损失由于动物疾病,特别是牲畜,量化货币条件。9作为一个例子,在荷兰,戴利的疾病负担的计算1200每年10欧洲食品安全局11弯曲杆菌病的成本计算为公共卫生系统和生产力损失大约在欧盟€2.4每年数十亿(包括动物损失是否还不清楚)。据估计,在世界范围内,弯曲杆菌病的原因5亿例疾病病例在人类社会。这个社会负担的经济成本是什么?如何打破这种估计在国家水平?

甚至近似成本所需的所有工业的干预措施和科学研究是很难估计的。然而,从社会经济的角度理解之间的交互是至关重要的微生物群的领域,在人类动物福利和发病机理。有那么多要做此——朝着一个更好的经济成本计算议程是非常高的,所以这方面不容忽视在社会计算。人类疾病是可以预防的,以及不必要的死亡,太重要了!

这不会给我们带来任何如果没有代表性取样。TOS的应用细菌的复杂抽样的大型肉类产业从养鸡场屠宰场是具有挑战性的,但是,它提供了获利的可能性合作服务条款和微生物学的基本原则!

引用

  1. 委员会监管(欧盟)2017年8月23日修改规定的2017/1495 (EC) 2073/2005号至于弯曲杆菌在烤肉上腾。https://eur-lex.europa.eu/legal-content/EN/TXT/PDF/?uri=CELEX: 32017 r1495&from = EN
  2. d . Harwani“伟大的平皿计数异常和unculturable细菌”,Int。j .科学。Res。2 (9)(2013)。https://www.worldwidejournals.com/international-journal-of-scientific-research- (IJSR) /文章/ the-great-plate-count-anomaly-and-the-unculturable-bacteria / MTc0Nw = = / ? = 1 b1 = =大部分
  3. K.M. Feye,湄汤普森,M.J. Rothrock Jr M.H.教授和南卡罗来纳州里克“家禽处理和微生物的应用映射”,家禽科学。99 (2),678 - 688 (2020)。https://doi.org/10.1016/j.psj.2019.12.019
  4. y商,s·库马尔,b .奥克利W.K.金,“鸡肠道微生物群:重要性和检测技术”,前面。兽医。科学。5,254 (2018)。https://doi.org/10.3389/fvets.2018.00254
  5. A.E.萌芽,文化自由的微生物学,一种新的快速Eubacterial分子诊断方法和临床微生物群特征。博士论文,sccp阿姆斯特丹(2016)。https://research.vu.nl/en/publications/culture-free-microbiology-a-new-approach-to-rapid-eubacterial-mol
  6. F.M.柯雷氏骨折,“porA平行测序揭示了一个复杂的模式弯曲杆菌基因型之间不同的肉鸡和肉鸡育种鸡”,科学。代表。9日,6204 (2019)。https://doi.org/10.1038/s41598 - 019 - 42207 - 9
  7. K.H. Esbensen, c . Paoletti和n Thiex (Eds),j .采用AOAC公认的Int。98 (2),249 - 320 (2015)。https://academic.oup.com/jaoac/issue/98/2
  8. c·拉姆齐“考虑取样的水”,j .采用AOAC公认的Int。98 (2),316 - 320 (2015)。https://doi.org/10.5740/jaoacint.14 - 251
  9. A.P.M.肖,j·拉什顿,f·罗斯,公关Torgerson,”计,美元和狗:如何控制人畜共患病”的经济学分析,启科学。科技。。Epiz Int。36 (1),147 - 161 (2017)。https://doi.org/10.20506/rst.36.1.2618
  10. M.J.J. margen、A.H. Havelaar R.A.J.A.M. Bernsen, r . Van Koningsveld G.A. De智慧,“人类的成本弯曲杆菌感染和荷兰的后遗症:戴利和cost-of-illness方法”,《阿格利司。Scand。C2 (1),35-51 (2005)。https://doi.org/10.1080/16507540510033451
  11. 弯曲杆菌。bdapp官方下载安卓版欧洲食品安全局(2021年9月20日访问)。https://www.efsa.europa.eu/en/topics/topic/campylobacter
亚伯Arkenbout

亚伯Arkenbout

我的名字是亚伯Arkenbout (MSc),毒理学家乌得勒支大学接受教育,荷兰。年代,我教育项目开发卫生部的传染性疾病和非法毒品市场的风险。与一个团队在一起,我成立了一个咨询公司关于这些主题的信息和教育在阿姆斯特丹,它现在已经成为一个全国性的咨询机构。作为一个科学家,我开发人群为基础和资助的研究项目和我的同事一起,ToxicoWatch基金会自2013年以来。这种担忧生物监测项目等持久性有机污染物(pop)二恶英(PCDD / F), dl-PCBs, sccp和pfa废物焚化。在我们多年的生物监测的研究中,我们使用植被(苔藓,松针和树叶)从后院的鸡和鸡蛋相关的生物标志物。借助创新分析生物像CALUX博士FITC-T4和pfa CALUX,持久性有机污染物在环境中可以检测到少量的皮克。ToxicoWatch咨询公司更侧重于分析挑战微生物学和调查潜在的持久性有机污染物的微生物降解。
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