碰撞截面(CCS)值在4 d-proteomics应用程序在使用后期处理为“运行之间的匹配”label-free定量。力量的TIMScore软件现在为CCS-enabled利用机器学习算法使搜索引擎能够提供更大的肽和蛋白质识别,同时保持严格的错误发现率。成千上万的实验数据点被用来训练ML算法,可以准确地预测CCS胰蛋白酶的和磷酸化肽的价值。磷酸化细胞信号和生物学中起着至关重要的作用,但磷酸化肽更难以识别。TIMScore磷酸化肽的数量增加了> 10% unenriched白血病细胞系埃里克·费希尔教授提供的样本达纳法伯癌症研究所。
