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原位测量3 d活真核细胞内的蛋白质结构

2019年6月4日|新闻
通过伊恩·迈克尔

东京都大学的研究人员已经成功地确定了高分辨率三维结构的蛋白质在活的真核细胞。他们结合“sensing”核磁共振(NMR)谱、生物反应器系统和先进的计算算法来确定蛋白质结构首次在拥挤的细胞内环半岛综合体育官方APP下载德甲境。技术承诺洞察致病蛋白的细胞内行为和新颖的药物筛选程序,允许原位可视化的蛋白质如何应对生化刺激。

真核细胞的构建块是一个巨大的各种生物,包括真菌、植物和动物。他们的内部结构非常复杂而多样的,复杂的结构层次和一个巨大的范围的《分布在细胞骨架网络。这使得它很难看到什么每个细胞内蛋白质的天然环境,尽管知道生物医学的好处是显而易见的,例如,一个特定的蛋白质反应,当细胞受到化学刺激,如药品。

应对这一挑战,助理教授领导的团队从东京都大学Teppei池谷Yutaka教授伊藤应用核磁共振光谱学测量内特定蛋白的表达半岛综合体育官方APP下载德甲sf9昆虫细胞培养,菌株的细胞最初源自一种蛾幼虫广泛用于蛋白质产量。团队的NMR工作已经成功地阐明高分辨率的蛋白质结构内部细菌(non-eukaryotes)。简单的问题将同样的技术应用于蛋白质sf9细胞的浓度明显降低目标细胞的蛋白质和寿命短,很难收集高质量的多维核磁共振光谱对核奥佛好塞效应光谱学(NOESY)将提供精确的信息如何不同的单个分子内原子间距。半岛综合体育官方APP下载德甲因此,他们结合稀疏sampling-based快速核磁共振测量方案与最先进的计算方法采用统计技术如贝叶斯推理,方法为阐明蛋白质结构有效的基于有限的结构信息从核磁共振光谱- sensing固有的低灵敏度。生物反应器系统装备也在核磁共振装置使得在测量细胞在一个健康的状态。

这个新的数据,团队能够阐明三种模型蛋白质的三维结构空前高分辨率,精度为0.5的蛋白质主链原子的位置。特别是,他们发现了一个明显不同的蛋白质的构象在局部地区在稀溶液相比,其参考结构。蛋白质的构象区别“细胞”和“试管”可能是由于非特异性的细胞内与其他分子的相互作用。越来越清楚的是,这些交互有助于蛋白质的生物功能:定位和量化的能力结构变化的蛋白质在细胞内环境中生物医学研究预计将产生重大影响,从而能够看到不同的条件,如神经退行性疾病,影响蛋白质构象原位,定量评估治疗如何影响结构异常。

他们报道的结果《应用化学国际版(doi:https://doi.org/10.1002/anie.201900840)。

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