单细胞中心青岛理工学院的研究人员生物能源和生物处理技术(QIBEBT)中国科学院已经开发出一种技术,土壤中细菌的基因组序列一个细菌细胞,同时土壤环境中识别它的功能是什么。
土壤是一个庞大而复杂的微生物,哪些特性可以说是最高的基因多样性和异质性的细胞的代谢活动。反过来,这些代谢活动原则上可以提供许多化合物的工业生产的基础价值。能够查明“谁在做什么”在土壤微生物直到现在一直是极其困难的决议的一个细胞,通常很多细胞,通常数以百万计的,必须同时进行了分析。
QIBEBT单细胞中心的2020年,研究人员开发出一种bacteria-profiling技术称为Raman-Activated Gravity-driven单细胞封装和测序,或愤怒测序。这个测序技术使用激光镊子和利用重力的属性允许细菌细胞的分析。细菌的形态和结构然后使用拉曼光谱研究。半岛综合体育官方APP下载德甲他们愤怒测序技术已经发展到一个新的科学仪器被称为Raman-activated细胞Sorter-Sequencer或RACS-Seq。它是第一个仪器,可以确定在一个细胞决议“谁在做什么”在复杂的生态系统。他们应用到土壤中的细菌。
单个细胞的拉曼光谱提供了一种内在的生化指纹,这反过来又可以作为代理的代谢活动。加上此单细胞拉曼光谱时探测的同位素参与此活动,这项技术可以揭示化学从细胞环境的占用。
通常使用同位素追踪或微量化学过程。通过喂食细菌D2啊,一般的代谢活动的细胞可以通过拉曼光谱跟踪。这项技术也可以检测不仅吸收D2但也不同的碳和氮的同位素。这甚至可以揭示生物分子的特定细胞的合成。这个代谢跟踪可以通过愤怒有关技术的单个细胞的基因组测序。
“这应该允许研究者“我”土壤找到感兴趣的细菌在商业生产的特定的类胡萝卜素,脂类、多糖、蛋白质和甚至抗生素”,微生物学家Jing晓燕表示QIBEBT单细胞中心。研究人员现在想进一步提高吞吐量的技术,目前每分钟几个细胞,加快和过程完全自动化。
“我们的最终目标是保持优化RACS-Seq仪器,使它成为一个普遍的和高度通用的工具精确地探测靶细胞或代谢活动的利益”,主任徐剑说QIBEBT单细胞中心。”,不仅从土壤,但从任何其他复杂的自然生态系统。”
