在一项新研究发现,斯克里普斯研究所的科学家们(TSRI)表明,气相色谱质谱法分析了从根本上改变了样品。
“我们发现,即使是相对较低的温度下使用小分子在气可以有不利影响分析”,研究高级作者加里•Siuzdak高级TSRI斯克里普斯的代谢组学中心主任。中使用新功能XCMS数据分析平台开发的Siuzdak实验室,研究人员观察到小分子解放甚至disappearing-during设计一个实验来模拟气相过程,把质疑气生成的数据的性质。
50多年来,化学家和生物学家已经使用gc - ms识别和测量浓度的小分子。当Siuzdak开启的新的实验为学生准备一个简短的课程在美国质谱学会年度会议。问题出现的gc - ms汽化过程的热量会如何影响结果,所以Siuzdak TSRI研究助理明梁方跑一组实验来比较小分子如何回应热应力。令他们吃惊的是,分子的多达40%的分子改变,表明气过程的热量可以显著改变样品的化学成分。
“结果非常令人震惊,这是一个已经使用了几十年的技术”,Siuzdak说。这一发现使研究者们仔细看看如何在气相分子降解和变换。他们分析了小分子代谢物加热60°C, 100°和250°C模拟样品制备和分析条件。该团队使用XCMS结合低温液相色谱质谱技术,之前一直不显示降低分子热,来确定热影响的程度。他们观察到显著的退化甚至在较低的温度下。在更高的温度,几乎一半的分子被降解或完全改变了。
“现在回想起来,有很少感到惊讶:热降解分子”,Siuzdak说。“然而,我们只是理所当然的热降解的程度。虽然这是一个消极的结果,科学家很少发布它们,我感觉有必要特别为学生在他们的职业生涯刚刚开始限制这种无处不在的技术报告。“已经发表在工作分析化学。
研究人员指出,甚至在气相分子通常不会观察也可以改变;例如,能源代谢物三磷酸腺苷(ATP)是很容易转化为磷酸腺苷(AMP)。这个转换相关的医学研究,因为科学家经常使用一个加热过程看ATP AMP在细胞的比率估计细胞衰老和疾病中的组件的功能。
“人们使用这个比例来检测疾病,但如果比例可以改变加热过程,结果会不准确”,方说。“众所周知,ATP是热敏感,但不是在这种情况下如何改变。”
热降解也可以解释为什么许多科学家发现很多未知的分子“山峰”过去。根据新的研究中,研究人员现在认为这些代谢物可能代谢物之间的加热过程——结果反应的副产品降低。
为什么没有科学家发现加热的影响直到现在?Siuzdak解释说,虽然一些科学家们注意到特定代谢产物的变化,很难看到变化总体分子概要文件包含成千上万的分子。这个omic-based研究之所以成为可能,是因为XCMS项目开发中的新功能TSRI斯克里普斯中心代谢组学。XCMS是一个免费的基于云的数据分析技术用于分析质谱数据在世界各地。
“XCMS,我们可以扩大我们的研究获得全球概要的代谢物altered-not几个化合物”,方说。
“幸运的是这些问题是可以克服使用标准气以及使用新的,环境温度质谱技术,和这份报告可能会刺激更多的科学家将这些破坏性的选择”,Siuzdak说。
