发现OneOmics套件
联系SCIEX要求更多的信息或演示这个软件。
基于云计算的质谱分析软件
使用基于云的软件在指尖的力量来提取和可视化质量spectrometry-generated大数据从蛋白质组学、代谢组学及基因组学项目在一个平台。迅速将这些数据转化为生物的见解,与合作者分享你的结果广泛且容易。
驱动大数据和云计算有意义的见解。
组织
访问和管理您的数据。从数据集创建实验。描述你的数据通过元数据定义。
识别
执行肽和蛋白质干扰识别。回顾你的识别结果和相关分析。
量化
分析你的定量数据,并组装成有意义的结果。回顾你的定量结果和相关分析。
解释
探索你的multi-omics通过校准和聚类结果。通过强大的探索获得生物信息工具。
实验管理器
蛋白质组学
代谢组学
BioReviews
iTRAQ
ProteinPilot
基于云计算的质谱分析
快速、安全、可共享的
基于云的软件的进步使研究人员询问大数据比以往任何时候都要快。云计算集成到OneOmics套件可以从转录组和质谱数据提取multi-omics数据都在一个地方
分析速度快
避免样品等待处理的队列和积压,并获得安全、精确的信息革命的速度。
- 快10倍比桌面处理
- 许多分析过程一下子没有性能损失
- 用户友好的大规模数据处理应用环境
- 集成工具来创建工作流在单一环境
安全存储和管理
处理你的数据与信心和保证最高的安全协议。轻松管理您的研究和组织你的结果,以反映您的实验室的配置。
- 亚马逊网络服务(AWS)安全标准,多站点同步存储
- 安全地从乐器到云环境中发送数据
- 减少了现场存储和计算能力的必要性
共享和协作
伙伴关系可以通过OneOmics套件同步繁荣,它的力量和忠诚使沟通和处理数据共享时间变得容易。涉及任何一方可以登录并开始。
- 很容易地共享项目(数据和结果)
- 没有更多的FTP站点或航运硬盘
- 访问数据和结果,从任何地方,在任何时候
一个云。无数的机会。
生产力的提高
处理更多的样本和得到更多的结果!我们基于云的质谱数据处理可以显著扩大您的实验室的生产力通过运行大量数据分析在同一时间。
强大的视觉效果
可视化数据以不同的方式探索同时所有组学方法,让你的研究和你的优势融资建议。
可伸缩性
OneOmics套件,你可以处理任意大小的数据,在任何时间,从任何地方,而不需要自己的基础设施。通过在云中,您的项目不会是有限的。
速度
基于云计算的处理可以运行和提取来自多个数据源的数据。避免样品等待处理的队列和积压,并获得安全、精确的信息革命的速度。
快速安装
基于云计算的软件轻松安装。希望没有额外的时间或金融需求和问题与数据处理和存储。期待简单的月供远程更新紧随其后
集订阅
选择一个最适合您的订阅实验室的分析和研究。
MULTI-OMICS
基本订阅MULTI-OMICS人员:
使用ProteinPilot IDA数据处理程序对蛋白质识别和离子库创建
NIST20准确质量代谢物谱库(AMMSL)代谢组学
片收购相对量化的数据处理
结果可视化:褶皱变化、火山的阴谋,和更多的情节
通路分析使用UniProt知识库,HMDB和reactome.org通路数据库
转换工具、装配和可视化DIA-NN报告
包括:
数据存储账户6结核的空间数据和结果:- 大约1000个蛋白质组样品在每个+ 4 GB
- 大约2000代谢组学样本在每个(或等效组合)1 GB
处理时间分配为大约1000蛋白质组样品和2000代谢组学样本(或组合)
技术支持通过电话、电子邮件和网站
应用笔记和有用的信息
将DIA-NN处理芝诺片DIA数据的数据集成到云处理管道
使用离子库和OneOmics DIA结果应用套件
片的光谱库生成收购在不到20小时
使用OneOmics套件和TripleTOF 6600 +系统
迅速推进定量蛋白质组学高通量片收购方案
微流LC OptiFlow涡轮V源6600年TripleTOF +系统和云处理
Multi-omics分析神经分化人类胚胎干细胞
处理片采集数据在云中OneOmics套件
代谢组学片采集数据的快速分析和解释使用基于云计算的处理管道
使用OneOmics套件SCIEX ZenoTOF 7600系统
40%以上的蛋白质识别使用MS / MS芝诺
使用ZenoTOF 7600系统,在云中OptiFlow离子源和OneOmics套件
安全
安全是至关重要的
OneOmics结合最佳实践安全在整个架构,包括只使用最新的通信加密标准(TLS)和就地存储数据的加密。每个版本的软件是受到第三方渗透测试和生产环境连续监测。
数据存储和实验
组织和创建
数据存储和实验
组织
在这些工作空间,您可以组装和定义的元数据在你的研究。
- 构建实验从上传数据
- 共享项目,例如数据和结果
- 分配学习水平的元数据
- 构建实验,并将它们添加到研究
- 蛋白质组学片DIA数据
- 代谢组学片DIA数据
- RNA表达数据
- 蛋白质识别数据
- iTRAQ试剂蛋白表达数据
- 模板用于元数据的任务
云存储
- 访问和管理数据上传到云SCIEX
- 存储你的处理结果文件
- 与合作者共享文件
ProteinPilot
识别和量化蛋白质更快
ProteinPilot
识别
这工作使您能够处理数据采集(DDA)数据的依赖。数据库搜索可以使用典范和职业集团执行算法。进行蛋白质鉴定和构建离子的图书馆。
识别蛋白质
- “多文件”搜索过程
- “上面”的搜索过程
查看结果
- 查看数据库搜索结果指标
- 查看蛋白质识别结果
- 查看MS / MS数据匹配的离子
评估基础数据质量分析
- 视图的蛋白质和肽识别关键的错误发现率(罗斯福)值
- 评估的质量色谱和消解时
- 深入每个小组发现更详细的信息
- 视图蛋白质识别和分类根据其未使用的蛋白得分
蛋白质组学
量化和可视化
蛋白质组学
量化
这个工作区包含多个应用程序帮助你进一步研究和片采集数据的处理。
器应用程序功能包括:
- 合并和保留时间(RT)对齐选择离子库
- 对每个片收购文件执行RT校准
- 提取并整合了碎片离子提取离子色谱(XIC)区域使用最终的离子库
- 肽峰组评分错误发现率(罗斯福)分析
汇编应用程序功能包括:
- 规范化调整峰面积表是相同的所有实验的规模
- 褶皱变化分析来确定方向,肽和蛋白质的折叠变化程度和信心
可视化
分析仪表盘
想象你的质谱蛋白质组学数据质量。
- 再现性
- 罗斯福分析
- 保留时间校正
- 动态范围
浏览器仪表板
可视化蛋白质表达的结果是清晰、简洁的格式。
- 样本分组
- 标准化质量
- 本体
- 蛋白质折叠的变化
- 盒子,晶须的情节
- 在蛋白质序列肽褶皱变化
蛋白质热图
蛋白质热量地图功能提供了一个概述蛋白质的表达的结果。这个用户友好的格式允许操作员调整过滤器来细化热图。巨大的数据捕获可以钻到一个单一的蛋白质变化在整个样本序列。
代谢组学
量化和可视化
代谢组学
量化
在这个工作区,您可以从获得的数据中提取关键代谢物领域然后规范化计算折叠变化(FCs)和信心。女士也可以评估数据质量研究和可视化的变化。
在这个工作区提取器提取和整合化合物峰使用NIST20和精确质量代谢物谱库(AMMSL)。
另一个特点是汇编功能,调整峰面积表在所有实验的规模。
褶皱变化(FC)分析还支持在这个工作区来确定方向,范围和代谢物FC的信心。
可视化
分析仪表盘
想象你的质谱分析代谢组学数据质量。
- 再现性
- 罗斯福分析
- 动态范围
浏览器仪表板
可视化代谢物表达式的结果是清晰、简洁的格式。
- 样本分组
- 标准化质量
- 本体
- 代谢物褶皱的变化
- 盒子,晶须的情节
- 代谢物和过渡峰地区样本
代谢物变化热图
代谢物的热量地图提供了一个概述的代谢物变化研究中允许您调整过滤提炼情节。全面的数据捕获和处理让你钻成单个分析物在样品看到变化在整个序列。
iTRAQ
被量化
iTRAQ
该工作区可以询问获得定量数据从样品标签与多路复用amine-specific,稳定同位素iTRAQ试剂盒:
- 识别蛋白质和过程的“文件”或“多文件”搜索
- 量化使用iTRAQ试剂
- 偏差纠正
- 归一化
- 背景校正
- 建立一个工作区
-
- 查看数据库搜索结果指标
- 查看蛋白质识别结果
- 查看MS / MS数据匹配的离子
- 下载组ProteinPilot工作区中的文件和查看
BioReviews
multi-omics集成研究
BioReviews
比较不同组学研究和评估。在BioReviews可以比较基因组学之间的定量数据,蛋白质组学和代谢组学实验。
它包括调整功能基因组学和蛋白质组学的结果,或比较多个蛋白质组学或多个代谢组学数据集。
- 结合研究大数据对齐
- 执行聚类分析和趋势分析,找到关键的相似之处和差异蛋白质,代谢产物或RNA定量数据
- 确定你的相似点和不同点的生物学意义
- 观点丰富生物通路
该工作空间的另一个特性是支持手动解决冲突时,映射到多个基因或一个蛋白质基因映射到多个蛋白质。
您还可以执行多个分析实验集,每个显示为一个瓷砖,并查看设置使用结果和链接:
- 十字路口:显示每个PCA-PCVG重叠和k - means组
- k - means:显示了集群
- PCA-PCVG:显示发现的趋势
- PCA-DA PCA:考虑已知样本分组
- 四:显示log2褶皱的情节变化与信心或log10(假定值),对每一个对比
- 区域和褶皱变化分析
离子库
从《创建离子光谱库
离子库
识别
这工作使您能够处理数据采集(DDA)数据的依赖。利用蛋白质识别帮助您构建离子库。
- 识别蛋白质
- “多文件”搜索过程
- “上面”的搜索过程
- 导航到您的离子库使用快捷键
- 离子库是用于蛋白质组学工作区OneOmics套件,他们也可以用作DIA-NN是工作流
DIA结果
量化和可视化
DIA结果
量化
这个工作区包含多个应用程序帮助你进一步研究和片DIA的处理数据。强大的视觉片提供的蛋白质组学工作区现在可供DIA-NN结果。
变换的应用
- 翻译一个DIA-NN多试样主要结果sample-specific兼容OneOmics套件的结果
汇编程序
- 正常化,调整峰面积表相同规模的实验
- 褶皱变化分析来确定肽和蛋白质折叠变化的方向和程度与信心
