蛋白质组学研究

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解锁新的蛋白质组精确的观点

使用蛋白质组学新技术使更多的研究应用程序通过最大化数据的深度。MS-based蛋白质组学提供了独特的优势,全面分析蛋白质及其变化,包括转录后修饰(天车),给全球生物系统的解释。

这种分析能力使科学界开发新仪器特点和小说工作流增加通用性,使以前寻求可能的应用程序。

蛋白质组学研究

信心从发现到转化研究

最大化你的数据的深度……

解锁新的蛋白质组精确的观点

使用蛋白质组学新技术使更多的研究应用程序通过最大化数据的深度。MS-based蛋白质组学提供了独特的优势,全面分析蛋白质及其变化,包括转录后修饰(天车),给全球生物系统的解释。

这种分析能力使科学界开发新仪器特点和小说工作流增加通用性,使以前寻求可能的应用程序。

概述

追求纳米发现大的世界的影响

蛋白质组固有的复杂性,多样性和动态范围,决定了需要最大限度地发现和量化的能力在不影响一种类型。

在生命科学的研究中,“猎枪”或自下而上的蛋白质组学(串联质/ MS)是一个关键的方法,全面分析蛋白质和他们的变化——包括转录后修饰(天车)——给全球生物系统的解释。一般来说,有两种主要的方法来产生串联质谱,这都是支持的SCIEX解决方案包括:数据采集(DDA)的依赖,也称为信息采集(IDA)的依赖,和片数据独立收购(DIA)。

目标肽量化

数据/信息依赖收购(DDA / IDA)

的速度和灵敏度ZenoTOF 7600系统,它使用使用陷阱芝诺的扫描速度超过> 133 Hz,提供最高质量的MS / MS数据视数据采集(DDA)期间,即使在low-abundance蛋白质。

蛋白质识别与数据独立的收购

片数据独立收购(DIA)

片DIA提供精确、广泛,label-free量化驱动生物标志物的发现和鉴定差异表达蛋白质。的能力在所有观察到的物种生成MS / MS数据速度使这种方法能够同时识别和量化成千上万的蛋白质,即使在短期时间和小样本加载。

发现蛋白质组学

自信的识别和量化

移动的研究发现转化,以外,更有信心和重大发现的见解在生物学和生物标志物签名的作用机制。从SCIEX使用最新的技术,一个全新的水平可以发现蛋白质组深度揭示独特的分裂模式和低丰富的物种。

  • 在分析大型、高

    在更短的时间内分析更多的样品

    大规模的实验往往需要回答人生的许多生物学问题。不仅每个样本更高的吞吐量降低总体成本分析,但在单个细胞蛋白质组学也非常重要,例如,要求成千上万的样品进行分析。

    促进这样的工作流,ZenoTOF 7600系统提供了最快的MS / MS速度高达133赫兹和超过订单异地恋不影响速度或决议。

    扩大覆盖面,提高责任周期

    敏感性收益是经济复苏的结果的占空比损失交配TOF的自然结果分析。

    芝诺陷阱提供更高的灵敏度和速度,提高MS / MS敏感性在整个质量范围与芝诺的陷阱。因此,≥90%的离子注入TOF前体离子信号增加~ 6倍和记者离子信号~ 10倍。

  • 生物标志物的发现

    生物标志物发现候选人

    能够自信地发现、量化和翻译新的生物标志物,以前无法标记将使研究人员开发测试,可以在早期识别和描述疾病,甚至发现标记,可以指导治疗这些疾病。传染疾病在早期阶段,给人们在正确的时间正确的药物将意味着更积极的前景和成千上万的病人恢复的机会。

    SCIEX解决方案的技术给你最富有,最全面的数据。

  • 单个细胞蛋白质组学

    蛋白质组学前所未有的深度和确定性

    的重大潜在隐藏在单细胞蛋白质组学高通量功能比以往任何时候都更重要。生物研究,以前被认为是不可能的现在放在触手可及的地方。

    采取单一细胞蛋白质组学下一个级别使用片DIA芝诺利用齐诺陷阱激活肽MS / MS 5-6x增加的敏感性在高吞吐量,片DIA工作流最大化的结果的样本集。

  • Immunopeptidomics

    增强独特肽检测在努力推进个性化医疗

    肽与主要组织相容性复合体(MHC)中发挥关键作用的免疫细胞识别并能引发癌症的抗肿瘤免疫反应。然而,这些肽存在于低丰度。

    SCIEX齐诺陷阱技术有助于克服这种限制提高MS / MS敏感性在整个质量范围,增加前体离子信号~ 3 ~ 10倍和记者离子信号。

    产生有害的疾病诊断离子的研究

    电子激活离解(EAD)提供了替代分裂能力生成签名离子区分等压氨基酸重要的细胞间的相互作用,免疫治疗和药物开发。

    虽然等压氨基酸分享相同的分子量,不同的结构可能会显著影响蛋白质功能特别是当发现complementarity-determining地区(CDR)抗体和t细胞受体。

在实验室SCIEX离子源
在实验室SCIEX质谱仪

新一代的蛋白质组学

蛋白质分析和表征

从转录后修饰(天车)全蛋白质组分析和表征,蛋白质的动态特性使其非常具有挑战性的分析。研究人员需要先进技术研究蛋白质动态可靠和可重复来确定蛋白质结构的变化,包括多功能天车剖析。SCIEX解决方案允许研究人员可靠和可重复概要蛋白质结构更改使用碎片的最新创新技术产生丰富和翔实的MS / MS。受益于一个注射100%的序列覆盖率和识别低铝的比以往任何时候都要快。

  • 天车剖析

    提高对天车定位的信心

    转录后修饰(天车)的保存修改后的氨基酸残基需要精确的天车定位和量化分析。电子激活离解(EAD)细胞防止中性丢失不稳定的铝(例如malonylation、磷酸化等)通过生产替代分裂模式导致c -和z离子。可调谐性细胞从0-25 eV进一步提供不同的分裂政权。

    此外,信号强度,从而显著改善光谱质量观察在使用陷阱芝诺结合含铅,使天车定位更加充满信心。

    克服挑战二硫化物键分析

    EAD碎片显示偏好打通二硫键,导致优越的识别序列覆盖率,使肽和半胱氨酸残基的位置有关。

    快速和全面质/女士多糖特性

    激活陷阱芝诺的敏感性显著的改善提供高肽乳沟报道甚至在快光谱积累时间;快速分裂和MS / MS收购允许含铅反应时间在10 - 30毫秒的秩序。

  • 肽图

    新的QA / QC分析深度的信心

    作为新一代生物制剂变得更加复杂和复杂的结构,分析工具的需求特征和质量评估是因此增加。SCIEX解决方案提供最新的技术来解决生物制药的严谨分析的挑战。

    电子激活离解(EAD)和快速的数据/信息依赖收购(分别为银两或IDA)使替代常规碎片,深入分析下一代蛋白质疗法和标准的单克隆抗体(mab)。

  • 量化

    相对量化MS-based蛋白质组学是一种有价值的方法。因为多肽与不同的序列可能有不同的电离效率,由此产生的强度在质谱不对应于他们的真正的丰度。要解决这个问题但是,各种标签和label-free方法已经开发出来,使比较蛋白质组学分析。

    通过比较同一肽从一个样本状态(如健康或患病的细胞),研究人员能够确定哪些多肽(蛋白质)是调节或在一定条件下使之抑制。

    Label-free量化

    标签免费量化(LFQ)需要高质量的数据分析得到有意义的结果,因为它不使用标签来计算样本之间的相对丰富的蛋白质和多肽。

    使用最新的SCIEX技术,MS / MS敏感性增加~ 5 - 6折与激活肽的陷阱,芝诺恢复仪器工作周期> 90%。
    因此,前体离子信号增加~ ~ 6倍和记者离子信号增加10倍。

    iTRAQ

    iTRAQ试剂是一个等压,peptide-tagging技术,使您将所有主要的胺,无论肽类。因为重要的信息,如转录后修饰(天车),保留,这个标签系统允许你从样品中提取更详细的信息。当结合传统的芝诺的高分辨率,增加责任周期陷阱技术,iTRAQ试剂标签是一个健壮的定量蛋白质组学方法。

针对蛋白质组学

感兴趣的监视和量化蛋白质绝对精度

验证和确认的蛋白质生物标记物需要精确,有针对性的量化在大量的样本,使翻译进入临床研究。SCIEX解决方案对目标蛋白质组学是由著名的MS / MS齐诺陷阱和灵敏度和精度进一步提高芝诺片DIA技术。

  • 多反应监测(MRM)

    高度多路复用和敏感目标蛋白质化验需要可再生的、健壮的量化方法,满足吞吐量的要求大样本集。在蛋白质组学,MRM方法是最敏感和准确的相对和绝对的蛋白质定量方法。

    是否来自生物假说或发现数据,7600和7500年SCIEX ZenoTOF系统通过MRM方法提供精确的量化目标。

    stMRM

    数据丰富的工作流,童子军触发MRM (stMRM),带来效率,更高层次的深度和研究打开新的和令人兴奋的潜力。

    MRM和MRM芝诺人力资源

    MRM人力资源和MRM方法是最敏感和准确的相对和绝对的蛋白质定量方法。结合定量的鲁棒性和高通量分析,大型和小型生物变化可以准确测量板在大样本人群广泛的蛋白质。

质谱实验室技术员在柏林夏洛——夏洛蒂

资源

蛋白质组学资源

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要library-free蛋白质识别使用片DIA芝诺和silico-generated光谱库

这片芝诺DIA工作流,使用一个在网上生成库处理DIA-NN软件,优于传统的猎枪蛋白质组学方法使用DDA芝诺的识别大量蛋白质从复杂样品,并同意两个常用的实验生成的库。

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芝诺MS / MS与微流色谱大国的芝诺片DIA工作流来量化更多的蛋白质

随着定量蛋白质组学的发展,大规模的生物群体,通常与珍贵的样本。这将创建需要获取数据速度和少量。芝诺片DIA,芝诺MS / MS和微流LC,有可能显著提高核心定量蛋白质组学的工作流。

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高通量定量蛋白质组学利用芝诺片DIA Evosep一个系统

在转化研究理解蛋白质和肽是重要的生物功能。这种方法达到5-6x MS / MS的敏感性,导致这种DIA的方法超越DDA对蛋白质识别和量化在复杂的矩阵。

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Nanoflow片芝诺迪亚高灵敏度蛋白质识别和量化

Nanoflow色谱中使用工作流获得最高的灵敏度。高质量色谱分离是很重要的,因为良好的峰形状和峰的分辨率可以减少离子抑制,让女士系统示例尽可能多的独特的肽。

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蛋白质定量在subnanogram加载使用片DIA芝诺和nanoflow色谱法

印度已经成为一个全面的工作流label-free定量蛋白质组学,允许收购MS / MS谱检测肽。芝诺片7600年ZenoTOF DIA系统利用陷阱激活芝诺5-6x肽MS / MS敏感性的增加片DIA工作流。

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大规模蛋白质识别ZenoTOF 7600系统上使用微流色谱法

代的光谱库通常被认为是一个耗费时间的过程,但在现实中,他们可以快速生成。使用微流色谱法与快速MS / MS QTOF收购,然后搜索云中的数据可以使图书馆代< 48小时。

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芝诺MS / MS显著提高量化为iTRAQ试剂标记蛋白质组样品

微分使用等压标签蛋白表达分析试剂和质谱分析仪器要求可以获得高分辨率的MS / MS在收购率高的敏感性量化。ZenoTOF 7600 MS / MS系统提供大改善敏感性。

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40%以上的蛋白质识别使用MS / MS芝诺

蛋白质组样品的一些最复杂的由质谱分析的样本。ZenoTOF 7600系统提供MS / MS ~ 5倍的涨幅敏感性分析肽时,这项研究调查了这个大获得识别利率敏感性的影响。

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大规模、有针对性,肽量化804肽与再现性高,使用MS / MS芝诺

高度多元化目标肽量化分析了探索MS / MS芝诺的量化能力。使用前804大标记合成肽的混合物进入血浆,肽敏感性的增加由于芝诺MS / MS被发现是5.6折。

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天车网站本地化和异构体磷酸化肽的分化

蛋白质磷酸化网站的特定位置上完全理解他们的角色在细胞过程中是很重要的。这里的使用和收益可调电子激活离解(EAD)此处则分析和自信site-localization评估7600年ZenoTOF系统。

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可调电子激活离解(EAD) MS / MS保护特别不稳定天车

确定身份和翻译修饰的精确位置(天车)蛋白质是重要的充分描述功能。这里,实用的电子激活离解SCIEX ZenoTOF 7600系统研究不稳定特性的多功能天车。

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高度敏感的量化SARS-CoV-2抗原的蛋白质在鼻咽拭子样本

调查的鼻咽拭子在盐水中使用的量化矩阵SARS-CoV-2蛋白质使用质/女士。灵敏度获得的收益将检测到7500系统和减少基体效应通过改变拭子存储介质的特点。

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可再生的目标肽分析使用高多路复用MRM化验

使用MRM调度算法构建高度复合肽MRM方法能使更多的MRM同时监控,同时保持最佳的居住和周期。大规模的量化目标肽的7500系统是使用微流色谱法评估。

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改善LC-MRM量化为环肽利钠肽家族的敏感性

环肽已被确定为重要的治疗方法。这是有关他们的血液和稳定潜在的口服给药。质方法开发水平的量化跟踪环肽在生物矩阵仍具有挑战性。

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使用微流色谱定量敏感性显著提升

越来越多的微流色谱法被应用,因为采用“甜蜜点”占据了更加敏感和固体之间的鲁棒性。

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增强肽的敏感性量化目标学校的分析

宿主细胞蛋白(学校)是主要的流程相关杂质伴随biotherapeutic重组产品在生产过程中。作为潜在的毒性影响的水平和效率的疗法,有很大要求的学校在整个开发范例的定量测定。

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